More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2821 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  293  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  38.36 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.92 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.11 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  35.81 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.28 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  34.69 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.9 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.46 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.24 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.65 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.3 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.92 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.1 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.1 
 
 
290 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.76 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.97 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.69 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.33 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.77 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  34.18 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.81 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.77 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.65 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  33.54 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.55 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.21 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.2 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.75 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.78 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.8 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.64 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.05 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.25 
 
 
288 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.1 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  32.41 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.79 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  35.66 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.03 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.56 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.62 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  35.71 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  38.41 
 
 
305 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  33.54 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32 
 
 
300 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.87 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.87 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.17 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  39.19 
 
 
286 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.87 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.76 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.41 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  35.26 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  32.43 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.46 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.97 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.03 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  34.48 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.21 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.55 
 
 
300 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.89 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  32.39 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  35.29 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.33 
 
 
207 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.21 
 
 
297 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  32.87 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.96 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
289 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>