More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4368 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  100 
 
 
175 aa  360  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  52.8 
 
 
180 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  45.66 
 
 
175 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  47.47 
 
 
162 aa  148  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  46.3 
 
 
173 aa  143  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  45.91 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  45.12 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  45.12 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  44.94 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  42.14 
 
 
157 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  41.51 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  41.88 
 
 
157 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  39.49 
 
 
182 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  39.49 
 
 
182 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  43.12 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  34.38 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  33.13 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  32.52 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  33.13 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  34.81 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.03 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.57 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  27.61 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.82 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.85 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  33.76 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  33.76 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.47 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.27 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  31.61 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26.83 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.92 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.84 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.34 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.34 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.05 
 
 
304 aa  64.7  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.53 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  29.56 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  28.66 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.48 
 
 
320 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.49 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  27.74 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  32.05 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.57 
 
 
288 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.93 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.9 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.93 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.85 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.81 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
141 aa  62.8  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.65 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.03 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  29.41 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  32.05 
 
 
135 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.86 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.48 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
148 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  31.1 
 
 
278 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.34 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  30.81 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.48 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.48 
 
 
152 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.48 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 
291 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
145 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.88 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
138 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
141 aa  61.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  28.82 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.12 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.03 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.3 
 
 
287 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>