More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4249 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  100 
 
 
133 aa  259  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  69.17 
 
 
133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  45.52 
 
 
149 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  42.76 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  40.94 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  41.67 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  45.77 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  40.94 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  42.47 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.57 
 
 
290 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  41.84 
 
 
147 aa  85.9  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.69 
 
 
180 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.73 
 
 
152 aa  84.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.9 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.91 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.73 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  45.58 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.07 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  38.57 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  38.13 
 
 
208 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.86 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.04 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.12 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  38.03 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.97 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.07 
 
 
286 aa  74.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.19 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.04 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.33 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.5 
 
 
297 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  39.1 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.77 
 
 
300 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.31 
 
 
287 aa  70.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.17 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.78 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.87 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  39.72 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.97 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.25 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40.15 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.87 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.79 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.46 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.92 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.1 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  33.8 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  38.73 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.81 
 
 
307 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.5 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.85 
 
 
294 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.79 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.22 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.59 
 
 
283 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  31.54 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.72 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.53 
 
 
415 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  32.86 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.25 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  32.52 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.96 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31.51 
 
 
301 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
128 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.08 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.58 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  30.56 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  30.56 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  30.56 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  30.56 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  26.12 
 
 
140 aa  59.3  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  30.56 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34.56 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.08 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.64 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.47 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>