271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0737 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.56 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  31.21 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.66 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  31.91 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.87 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.97 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.97 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  33.63 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.5 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.56 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  28.77 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  28.47 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.03 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.14 
 
 		 276 aa  52.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  26.95 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.7 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.17 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.45 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.57 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  28.47 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.99 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  29.57 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.5 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  27.89 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.16 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.14 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.06 
 
 		 283 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  31.75 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  29.57 
 
 		 145 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.37 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.51 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  27.7 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.25 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  26.24 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  27.33 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  28.76 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.25 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  29.05 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26.97 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.25 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.14 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  26.57 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  26.57 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.17 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  26.53 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.43 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27.34 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.25 
 
 		 148 aa  48.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  26.39 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  25.87 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.87 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  26.85 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.82 
 
 		 294 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  25 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  31.76 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 314 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  28.28 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.73 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.08 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 278 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.47 
 
 		 301 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  28.67 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.21 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 		 750 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.52 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>