More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1308 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  100 
 
 
145 aa  287  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  47.1 
 
 
144 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.19 
 
 
144 aa  107  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  39.01 
 
 
145 aa  100  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  38.57 
 
 
147 aa  100  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  37.93 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  41.22 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.19 
 
 
152 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.29 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.57 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  38.89 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  36.43 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36.91 
 
 
156 aa  85.9  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.23 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.88 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.62 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.97 
 
 
151 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.14 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.18 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.17 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  39.58 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.73 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.14 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  34.01 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  39.58 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  32.35 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.19 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  37.5 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.76 
 
 
290 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
145 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35 
 
 
156 aa  76.6  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  38.3 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  37.59 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.62 
 
 
288 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  36.88 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  34.72 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  36.17 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  36.17 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  36.17 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.56 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.37 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  36.17 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  36.17 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  36.17 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.79 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.55 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  35 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.56 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.82 
 
 
301 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  35.29 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.33 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.93 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.45 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  35.46 
 
 
297 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.97 
 
 
280 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.61 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  32.19 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.87 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.64 
 
 
300 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.94 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  32.64 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.21 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  32.86 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  32.17 
 
 
283 aa  62  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.14 
 
 
294 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30.77 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  35.21 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  32.62 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.88 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  34.51 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  29.79 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  29.86 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.71 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  31.43 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  29.79 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.03 
 
 
287 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>