More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0432 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  289  9e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  54.93 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  47.86 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  45.71 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  44.44 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  47.89 
 
 
152 aa  114  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  45 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  42.07 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  38.19 
 
 
145 aa  107  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  42.25 
 
 
290 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  43.75 
 
 
158 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.06 
 
 
159 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.01 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.62 
 
 
180 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  45.32 
 
 
280 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  41.55 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.85 
 
 
300 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  45.65 
 
 
281 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.57 
 
 
207 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.16 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  40.96 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.58 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.61 
 
 
153 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.59 
 
 
307 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.97 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.46 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.62 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.04 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.85 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  43.36 
 
 
136 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.43 
 
 
156 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.57 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.31 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.72 
 
 
288 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.81 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.46 
 
 
142 aa  87  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.29 
 
 
286 aa  86.7  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.06 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  38.16 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  34.48 
 
 
301 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.19 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.14 
 
 
152 aa  84.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  36.81 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.89 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  38.73 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  39.13 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.17 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.14 
 
 
297 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  36.05 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.32 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.75 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  38.93 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  33.1 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  34.03 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.03 
 
 
415 aa  76.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.73 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  35.97 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  40 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  40 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  35.29 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  35 
 
 
281 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  36.5 
 
 
283 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  36.88 
 
 
301 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.03 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.43 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.92 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  35.59 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36.49 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  36.99 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  29.93 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.97 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.97 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.41 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.12 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.56 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.1 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.84 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>