More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3038 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  291  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  49.31 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  50.35 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  43.05 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  42.28 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  42.55 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  41.72 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  44.14 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.14 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.24 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  40.43 
 
 		 290 aa  105  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38.41 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  39.74 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  39.13 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  37.25 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  39.57 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.36 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.42 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.17 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.47 
 
 		 307 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.62 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.17 
 
 		 288 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  39.06 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.86 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.62 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.9 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.86 
 
 		 305 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.85 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.69 
 
 		 208 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.71 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.67 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.64 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.57 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.03 
 
 		 286 aa  87.8  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  34.25 
 
 		 200 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.89 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.68 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.29 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.14 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.76 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  38.03 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  37.06 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 159 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  36.3 
 
 		 159 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 159 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  37.06 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  34.93 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  38.69 
 
 		 281 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.27 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.41 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.51 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  34.04 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.29 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.21 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  32.39 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  34 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.1 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.07 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  32.62 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.1 
 
 		 415 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.24 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.62 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  32.62 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  33.55 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  33.55 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  33.55 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  33.55 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.97 
 
 		 283 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  33.55 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  33.77 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.33 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>