More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0224 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  100 
 
 
151 aa  293  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  62.07 
 
 
152 aa  174  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  61.33 
 
 
156 aa  169  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  60.96 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  57.64 
 
 
154 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  44.3 
 
 
152 aa  114  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  48.34 
 
 
180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  44.67 
 
 
307 aa  93.6  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.84 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.38 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.96 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.66 
 
 
159 aa  90.1  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  43.06 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  42.66 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  42.47 
 
 
207 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  43.66 
 
 
280 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.93 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.3 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.06 
 
 
150 aa  87  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  40.82 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  41.1 
 
 
208 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.9 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  37.32 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.96 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  40.56 
 
 
288 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 
148 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.36 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.91 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  42.86 
 
 
283 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  41.83 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  42.21 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  37.41 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.97 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  40.69 
 
 
290 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.11 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.94 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  41.84 
 
 
320 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.14 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  38.1 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.84 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.89 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  38.3 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  36.99 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.17 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  36.6 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  36.6 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  36.73 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.23 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.89 
 
 
415 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  37.33 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  37.33 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  42.5 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  31.58 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  36 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.37 
 
 
169 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  38 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.62 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.1 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.36 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.24 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  37.67 
 
 
294 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  35.17 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  35.76 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.21 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  37.67 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.01 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.86 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  30.28 
 
 
306 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  34.85 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.72 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.37 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.14 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  33.56 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  35.14 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>