More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1409 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  100 
 
 		 118 aa  236  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.7 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  47.41 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  39.72 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  47.06 
 
 		 208 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  45.38 
 
 		 290 aa  91.3  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  45.16 
 
 		 180 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  47.41 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  44.64 
 
 		 294 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  40.17 
 
 		 288 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.14 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  45 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  40.52 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40.52 
 
 		 280 aa  80.5  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  42.11 
 
 		 281 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  36 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  39.84 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  42.61 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  39.64 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  45.3 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.7 
 
 		 297 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38.46 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  41.54 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.7 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38.39 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.79 
 
 		 287 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.1 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.26 
 
 		 300 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  42.24 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  42.61 
 
 		 415 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.26 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  39.47 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  40.5 
 
 		 286 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  40.16 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.45 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  45.24 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  39.02 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.48 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.75 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.33 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.34 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  42.24 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  38.53 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  43.37 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  43.33 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  36 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.61 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.61 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.61 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  40.35 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  42.68 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  39.47 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  38.14 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.27 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.24 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  39.29 
 
 		 283 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.87 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  40.87 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  42.61 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.8 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  36.84 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  40.48 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.46 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  40.51 
 
 		 324 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  38.84 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.51 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  43.37 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.19 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.21 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  48.53 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  40.74 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.29 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.27 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  38.32 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  36.13 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  42.5 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  39.13 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.43 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  34.15 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.44 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  48.39 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  37.93 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  38.05 
 
 		 295 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  39.77 
 
 		 289 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  34.78 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.97 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  33.63 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>