More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0973 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  100 
 
 
155 aa  307  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  70.95 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  61.49 
 
 
156 aa  187  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  61.33 
 
 
156 aa  186  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  45.58 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  45.27 
 
 
144 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.51 
 
 
290 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  45.45 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  42.86 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  42.18 
 
 
288 aa  110  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.42 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  46.26 
 
 
307 aa  106  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  39.26 
 
 
169 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  43.92 
 
 
150 aa  104  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  44.3 
 
 
152 aa  104  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.92 
 
 
297 aa  104  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.36 
 
 
150 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.84 
 
 
151 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
145 aa  101  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
145 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.37 
 
 
207 aa  100  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40 
 
 
281 aa  100  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.84 
 
 
141 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  42.57 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  37.93 
 
 
164 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  41.33 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  39.6 
 
 
208 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.91 
 
 
159 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.42 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  41.1 
 
 
287 aa  97.1  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.16 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.03 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  41.72 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  38.1 
 
 
149 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 
143 aa  94  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  41.78 
 
 
283 aa  93.6  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40 
 
 
280 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.78 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  42 
 
 
301 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.46 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.71 
 
 
286 aa  91.3  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.38 
 
 
300 aa  90.9  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.96 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  34.97 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.18 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  39.38 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  40.13 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  40.54 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.55 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.44 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.24 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  33.78 
 
 
301 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.75 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  41.29 
 
 
283 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.26 
 
 
415 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.27 
 
 
305 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  36.84 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.97 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.51 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  34.23 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.74 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  37.41 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
163 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  34.9 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  40 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  35.57 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  31.97 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.97 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.33 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
297 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.16 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  40.54 
 
 
294 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  36.36 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
274 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  35.53 
 
 
200 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.36 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  37.74 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  36.73 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  37.74 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  36.73 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>