More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2678 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  308  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  89.19 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  70.07 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  64.83 
 
 		 147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  65.77 
 
 		 151 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  62.07 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  67.35 
 
 		 148 aa  201  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  59.18 
 
 		 151 aa  199  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  43.84 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  41.1 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  42.47 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  42.57 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  40.41 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  40.54 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.97 
 
 		 208 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.44 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.1 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  33.81 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 308 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.88 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  35.71 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.93 
 
 		 290 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  33.1 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 308 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.37 
 
 		 207 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  36.73 
 
 		 303 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.86 
 
 		 288 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.23 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  36 
 
 		 304 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  40.4 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  36.6 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  38.1 
 
 		 307 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  37.58 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  36.49 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  31.21 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.55 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  36.49 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  34.48 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  37.66 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.05 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  39.1 
 
 		 280 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  35.62 
 
 		 288 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.91 
 
 		 320 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  36.24 
 
 		 303 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.44 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  34.04 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.91 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 162 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.21 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  83.6  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 278 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.79 
 
 		 187 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.24 
 
 		 287 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  33.78 
 
 		 289 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  37.32 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  35.9 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.73 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.64 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  41.38 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.64 
 
 		 307 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.1 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.34 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  32.45 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  32.45 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  36.55 
 
 		 217 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.13 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>