More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0833 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  100 
 
 		 169 aa  336  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  43.9 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  44.51 
 
 		 144 aa  111  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  41.1 
 
 		 288 aa  110  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  42.07 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  42.42 
 
 		 207 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  43.03 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  43.98 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.79 
 
 		 307 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  39.26 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  40.72 
 
 		 290 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.72 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  41.36 
 
 		 281 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  42.33 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  39.41 
 
 		 280 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  40.96 
 
 		 297 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  40.61 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.26 
 
 		 287 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  40.96 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.97 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.76 
 
 		 286 aa  92.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.43 
 
 		 149 aa  90.9  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.5 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.61 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.71 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  39.13 
 
 		 301 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  41.51 
 
 		 300 aa  89  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.64 
 
 		 141 aa  87.4  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36.84 
 
 		 151 aa  87.4  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.13 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  36.36 
 
 		 301 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.8 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  38.13 
 
 		 118 aa  85.5  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.62 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.58 
 
 		 148 aa  84.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.06 
 
 		 152 aa  84.3  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.78 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.9 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.06 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  36.53 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  37.06 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  36.9 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  37.13 
 
 		 283 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.54 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.93 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.34 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  37.95 
 
 		 297 aa  80.9  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.48 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.13 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.58 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  36.59 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  35.58 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  35.37 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  35.57 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 317 aa  77.4  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.1 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.94 
 
 		 320 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.66 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  29.09 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  31.36 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.37 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.95 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.06 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  43.96 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  38.41 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.16 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.72 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.53 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.74 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  46.88 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.73 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.2 
 
 		 415 aa  74.7  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.53 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  34.73 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  43.82 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.93 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  33.73 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.34 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.52 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  34.32 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  31.18 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.06 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  34.55 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.95 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.91 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  38.79 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.71 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.81 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.81 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  37.93 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  32.1 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.3 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>