More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1963 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  76.19 
 
 		 147 aa  232  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  74.48 
 
 		 146 aa  225  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  73.79 
 
 		 149 aa  221  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  68.28 
 
 		 150 aa  202  9e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  54.48 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  43.05 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  42.57 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  39.74 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  40.82 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  40.69 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.17 
 
 		 320 aa  94.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  39.31 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.85 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.97 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.89 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.25 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.51 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  36.81 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.33 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.25 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.25 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.66 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.41 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.56 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.03 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.78 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.49 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.29 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.17 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.86 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.56 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.41 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.48 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.34 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.59 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  31.52 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  34.03 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.11 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  36.55 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.04 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.56 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.24 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  31.72 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.72 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.67 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  33.33 
 
 		 297 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.61 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.41 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.9 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  34.01 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.39 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  52.63 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.66 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.79 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.91 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.4 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.75 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.9 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.64 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>