More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0180 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  38.62 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.82 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  36.05 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  94.4  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.93 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  37.16 
 
 		 148 aa  90.5  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.14 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.7 
 
 		 304 aa  85.5  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 308 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.67 
 
 		 300 aa  84.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38.46 
 
 		 150 aa  84.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.53 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  35.29 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  35.85 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  35.29 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.89 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.9 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.53 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.87 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  34.48 
 
 		 307 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  36.3 
 
 		 305 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.67 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.26 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.87 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.93 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.97 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.18 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  32.9 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.21 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.61 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.9 
 
 		 303 aa  73.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.72 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  34.51 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  35.53 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  32.19 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.58 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.76 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.61 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.55 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.82 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.53 
 
 		 305 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  33.1 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.54 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.47 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  52.86 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  35.76 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.13 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  35.76 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.49 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.71 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  32.67 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.96 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.91 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.7 
 
 		 314 aa  67.4  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  30.87 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  32.92 
 
 		 415 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.03 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.69 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.66 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.21 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.24 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.61 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>