More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1142 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  291  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  55.4 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  51.08 
 
 
146 aa  157  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  51.43 
 
 
149 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  52.86 
 
 
149 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  50.71 
 
 
145 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  50.71 
 
 
145 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  52.14 
 
 
146 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  51.06 
 
 
146 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  51.43 
 
 
146 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  47.86 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  52.14 
 
 
145 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  50.71 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  52.14 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  49.3 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  43.17 
 
 
143 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  43.17 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  44.52 
 
 
146 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  43.84 
 
 
146 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  37.24 
 
 
166 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  41.22 
 
 
140 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  36.17 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  35.97 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.08 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  32.7 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  33.55 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  33.55 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.61 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.41 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  55.36 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.65 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.56 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.94 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.29 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.14 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  30.34 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  30.52 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.03 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  31.65 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  31.65 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  28.93 
 
 
182 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  28.93 
 
 
182 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  30.61 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.3 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.92 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.77 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.77 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.27 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.86 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.95 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2171  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.17 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.9 
 
 
320 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  29.93 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  27.46 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.47 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.46 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  33.57 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  30 
 
 
162 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  33.79 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.21 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.8 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  33.55 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.08 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.72 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.47 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.71 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.67 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.67 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  28.67 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.51 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  25 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>