More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0504 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  294  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  46.31 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  46.98 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  46.98 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  36.49 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  43.24 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  42.95 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  40.41 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  37.41 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  40.27 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  37.41 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  37.84 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  38.1 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  35.86 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  40.14 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  35.17 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  34.13 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  33.55 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  34.25 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  37.16 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.8 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  33.33 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.67 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  37.67 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.53 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.48 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.75 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.25 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  31.65 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  34.23 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  32.89 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.48 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  31.94 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  31.94 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.53 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.14 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.52 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.71 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.5 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.54 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  35 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2890  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  30.88 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.22 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.26 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.46 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2558  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.14 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.97 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3156  universal stress protein  31.76 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  34.67 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  27.45 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.52 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.29 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.24 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.96 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.79 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.64 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>