More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3520 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  76.35 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  76.19 
 
 		 145 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  76.19 
 
 		 145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  82.43 
 
 		 146 aa  223  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  77.03 
 
 		 146 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  77.7 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  68.92 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  77.03 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  77.03 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  76.71 
 
 		 145 aa  204  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  52.74 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  49.3 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  47.52 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  48.3 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  39.86 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  39.86 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  38.93 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  38.93 
 
 		 143 aa  97.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  38.1 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  37.84 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  37.41 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  34.18 
 
 		 182 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  34.18 
 
 		 182 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  35.67 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  34.44 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  32.89 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  33.77 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.21 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.59 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.72 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.71 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.77 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.69 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  31.88 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.11 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  31.03 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.13 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.21 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  34.23 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.19 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.2 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  30.13 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  29.45 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  29.5 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  38.95 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.14 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  31.21 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2171  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  30.34 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  29.37 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.07 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.58 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.29 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  32.5 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  29.93 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  32.08 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  30.97 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  32.08 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  32.86 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.72 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  29.08 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.56 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.67 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32.45 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.34 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.58 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.92 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.76 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  27.21 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.37 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  39.08 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.13 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>