More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0340 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  100 
 
 
160 aa  329  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  44.38 
 
 
180 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  40 
 
 
157 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  43.9 
 
 
164 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  43.9 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  38.36 
 
 
177 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  41.36 
 
 
173 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  40.51 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  40.51 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  42.41 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  40.61 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  39.13 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  39.13 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  36.71 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  36.81 
 
 
158 aa  97.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.75 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.28 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.38 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  33.12 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.1 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.43 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  27.67 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.39 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.57 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  33.13 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  33.13 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  29.88 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
137 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.5 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.57 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.65 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  39.77 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  31.45 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.16 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.12 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.39 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  31.87 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.62 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.36 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  33.13 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.56 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  33.13 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.09 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.56 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
143 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.95 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  34.38 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.75 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  29.94 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.58 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  28.66 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.01 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  34.38 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  25 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.95 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25.15 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.75 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  30.43 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  27.61 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  46.27 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  30.82 
 
 
140 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.58 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  32.3 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.38 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.75 
 
 
307 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.38 
 
 
149 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.19 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.19 
 
 
170 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  30.25 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  27.78 
 
 
149 aa  60.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.45 
 
 
304 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  27.95 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  27.95 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  28.26 
 
 
130 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  27.95 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  27.95 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>