More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4652 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  53.12 
 
 
164 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  53.12 
 
 
164 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  52.8 
 
 
175 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  49.06 
 
 
173 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  47.71 
 
 
175 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  49.37 
 
 
154 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  46.84 
 
 
162 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  41.67 
 
 
177 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  42.14 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  45.81 
 
 
157 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  45.81 
 
 
157 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  42.31 
 
 
182 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  42.31 
 
 
182 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  42.33 
 
 
160 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  34.36 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  35.03 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.26 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  34.18 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  32.12 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.49 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  31.68 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.61 
 
 
314 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.76 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.66 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  34.19 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.03 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.77 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  31.9 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.08 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  32.92 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25.93 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.86 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.13 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.68 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.13 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.87 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.07 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.07 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  29.87 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.77 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.99 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.03 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  27.95 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.94 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  31.01 
 
 
139 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  31.68 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  27.65 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
138 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.25 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.1 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  33.55 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  29.87 
 
 
148 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.11 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.03 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30 
 
 
301 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.66 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.13 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.75 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.32 
 
 
138 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.3 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
144 aa  62.4  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  31.9 
 
 
135 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.43 
 
 
147 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.92 
 
 
304 aa  61.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.03 
 
 
147 aa  61.2  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
143 aa  61.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 
147 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 
141 aa  60.8  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.14 
 
 
151 aa  60.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.13 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  28.4 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.01 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>