More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1821 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  44.22 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  43.42 
 
 
148 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  46.26 
 
 
146 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  103  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
149 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  41.1 
 
 
151 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40.82 
 
 
147 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  39.6 
 
 
149 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  39.6 
 
 
149 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  38.1 
 
 
147 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
144 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 
171 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  40 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  44.3 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  39.33 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  34.44 
 
 
148 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  38.67 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  34.44 
 
 
148 aa  92  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  39.46 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  36.05 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  39.46 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  35.81 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  34.46 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  37.84 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.81 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  38.78 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  36.73 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  39.07 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  35.14 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  35.14 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  34.46 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  32.67 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  35.14 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  38.56 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.46 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.55 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.57 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.06 
 
 
180 aa  77  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.42 
 
 
158 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  38.26 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.67 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  30.67 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  32.89 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  35.76 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.58 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.36 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.93 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.64 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  30.46 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.76 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.46 
 
 
200 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  29.33 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  29.33 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  29.61 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.48 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.76 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.25 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  33.96 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  33.96 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  35.76 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  31.08 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.21 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>