More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1646 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  48.63 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  47.95 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  46.48 
 
 
162 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  45.07 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  43.84 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  40.41 
 
 
150 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  42.18 
 
 
149 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  43.06 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 
152 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
166 aa  113  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
166 aa  113  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  39.73 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  39.73 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  40.14 
 
 
150 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.99 
 
 
145 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
155 aa  94.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.14 
 
 
145 aa  94  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  38.51 
 
 
164 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  35.62 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  35.86 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.77 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  29.93 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.67 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.99 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  28.77 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.27 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  30.28 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.08 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.41 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.14 
 
 
305 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  26.71 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.97 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.94 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.53 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.87 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.87 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.41 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.86 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  28.17 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  29.45 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.77 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  30.07 
 
 
277 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  26.22 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  26.22 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.95 
 
 
290 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.47 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  31.06 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.08 
 
 
187 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  31.76 
 
 
288 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  26.71 
 
 
148 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.94 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.25 
 
 
305 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.9 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  27.59 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  25.77 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.86 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.92 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.64 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.08 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>