More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3036 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  92.52 
 
 
147 aa  266  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  91.16 
 
 
147 aa  265  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  76.19 
 
 
146 aa  224  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  64.19 
 
 
148 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  54.36 
 
 
148 aa  155  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  55.03 
 
 
152 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  57.05 
 
 
152 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  57.05 
 
 
149 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  52.98 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  50.76 
 
 
133 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.1 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  36.05 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.1 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.79 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  39.46 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.78 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.41 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.89 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.03 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.28 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  34.62 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.53 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.54 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.94 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.87 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
295 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.03 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  31.76 
 
 
295 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
295 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  28.76 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.76 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  30.14 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.78 
 
 
317 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.7 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
289 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.45 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.03 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.7 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  33.1 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  34.25 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.41 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
294 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  25.35 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  30 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.1 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.86 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.53 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.48 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.33 
 
 
164 aa  52  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.33 
 
 
294 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.74 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.48 
 
 
139 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  25.33 
 
 
166 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
140 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.92 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
147 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  28 
 
 
150 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
144 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  28.19 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  32.65 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>