131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0180 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  65.75 
 
 
147 aa  210  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  57.93 
 
 
145 aa  170  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.05 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  28.38 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  28.86 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.28 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.28 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  28.19 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.67 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.67 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  29.56 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.79 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  31.79 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  27.4 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.33 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.76 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  28.76 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  30.57 
 
 
157 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.49 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.57 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.65 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.97 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  26.71 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
163 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
155 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  26.25 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  26.32 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  24.84 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.08 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  28.87 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  27.81 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 
300 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  31.29 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  25.87 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  32 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  32 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  32 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  26.16 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  26.16 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 
297 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  32 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  24.82 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  25.31 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  25.31 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
300 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.1 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.78 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.52 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  24.68 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.39 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  29.05 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.21 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.76 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  25.34 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  29.33 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  24.84 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  28.95 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.67 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  30.56 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  24.53 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
293 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  26.76 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  28.28 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.37 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  24.29 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>