More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1678 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  46.53 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.04 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  39.58 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  39.73 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  37.67 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  42.36 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  40.69 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.56 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  36.18 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  35.1 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.11 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.05 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  32.41 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  34.27 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.26 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.97 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.69 
 
 		 290 aa  70.5  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  32.26 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.14 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.26 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.27 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.87 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.63 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.82 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.28 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  32.88 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  29.08 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.28 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.58 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.76 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  30.86 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  30.86 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.94 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  30.14 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.29 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  32.19 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  34.25 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.37 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.51 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.11 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  32.88 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  32.41 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  33.78 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.18 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  31.54 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.45 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  29.22 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.1 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.72 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.79 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.69 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.81 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.11 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.37 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  32.5 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.97 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.56 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  26.81 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  29.29 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.92 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  32.17 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.61 
 
 		 320 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>