197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0631 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  100 
 
 		 146 aa  299  8.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42.76 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.92 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  35.86 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  36.24 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  33.79 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  31.97 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.25 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.06 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  29.93 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  32.64 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.93 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 300 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.45 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  30.28 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.76 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.67 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.37 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.54 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.28 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.37 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.33 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.78 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  29.86 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  29.08 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.17 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  26.11 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.61 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  28.08 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  24.83 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  28.19 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  28.17 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.87 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  26.85 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.88 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.88 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.14 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  27.97 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  23.13 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.32 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.58 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.48 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.38 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.66 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.97 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  29.45 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.07 
 
 		 286 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  29.68 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.93 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.17 
 
 		 294 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  25.31 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.21 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.87 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.21 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  24.66 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 291 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>