More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1664 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  310  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  42.18 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.01 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  40.41 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32.65 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  32.08 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.32 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.33 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.77 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.69 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.45 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  31.65 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.9 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.95 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.99 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  38.06 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  30.63 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  33.77 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.97 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.67 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  33.77 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.26 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.37 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.64 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.91 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.37 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.79 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.73 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.72 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  33.97 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.77 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  33.97 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  33.78 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.61 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  33.33 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.97 
 
 		 300 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.58 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.93 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  29.38 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  29.38 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.11 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.21 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.79 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.18 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.57 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.17 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  30.46 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  33.76 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  32.48 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  32.67 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.67 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  32.89 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  29.25 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  27.44 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.76 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30.67 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  29.75 
 
 		 177 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.85 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  33.11 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  38.1 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  30.67 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>