More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4616 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.55 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.13 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.29 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  37.24 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.11 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.1 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  32.69 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  32.39 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  31.58 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  36.3 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  36.62 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  33.8 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  31.41 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  32.88 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  32.41 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  32.41 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  32.41 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  30.57 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  32.41 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  32.41 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.42 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  32.41 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.94 
 
 		 300 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.97 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  32.41 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  33.57 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  33.57 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  31.72 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.39 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  31.54 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.94 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.29 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  32.37 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.14 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 288 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  34.27 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  34.29 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.8 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  27.66 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.22 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.61 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  33.33 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  29.94 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  31.97 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  28.57 
 
 		 308 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  28.17 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  30.28 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.39 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  29.79 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.57 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  27.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.86 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  27.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  27.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.58 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  31.93 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  33.56 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  27.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  27.78 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>