More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2888 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  100 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  55.17 
 
 
145 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.55 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.57 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  36.42 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.78 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.57 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  37.23 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.79 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  35.17 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.99 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.61 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.37 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  32.21 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.78 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.79 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  35.58 
 
 
217 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  34.01 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.93 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.57 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.17 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.19 
 
 
162 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.04 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  43.37 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  43.37 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.29 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.05 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  36.49 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  29.58 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.33 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.78 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.93 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  35.66 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  35.66 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.11 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  36.3 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.44 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.94 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  44.58 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  38.03 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  31.54 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.17 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  34.97 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  32.65 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  39.04 
 
 
325 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.87 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.04 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  35.14 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.03 
 
 
303 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  50 
 
 
280 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  32.62 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  36.36 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.05 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  34.27 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.01 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  48.28 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  36.36 
 
 
297 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  35.17 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  37.7 
 
 
288 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  31.08 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.08 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  33.1 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.33 
 
 
288 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  33.97 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  28.57 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>