More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0515 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  100 
 
 
151 aa  306  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  88.08 
 
 
151 aa  278  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  80.79 
 
 
151 aa  258  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  77.48 
 
 
151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  77.48 
 
 
151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  66.89 
 
 
151 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  38.1 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  34.97 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  38.46 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  33.1 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.67 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.06 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.93 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.25 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.12 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.81 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.25 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.25 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.25 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.25 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.25 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.56 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  31.79 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.26 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.9 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.21 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.24 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.25 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  28.57 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28.57 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.77 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.68 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  31.08 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.61 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28.57 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.08 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.77 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.07 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.19 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.26 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  24.34 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  34.4 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  26.21 
 
 
208 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  28.48 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28.77 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.03 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  28.48 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.33 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  31.54 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  25.85 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  32.67 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  31.76 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.76 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  34.23 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.88 
 
 
292 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
292 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
292 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.93 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.86 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  30.52 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.03 
 
 
300 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  31.13 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.51 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.61 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  26.24 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  30.34 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.87 
 
 
291 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.48 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>