More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0631 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  100 
 
 
160 aa  321  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  46.94 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  37.58 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  39.07 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
141 aa  90.5  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 
138 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  37.33 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.67 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  38.67 
 
 
143 aa  85.1  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
147 aa  85.1  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
140 aa  84  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  35.33 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  37.34 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  39.47 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  37.34 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.51 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  36 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  35.71 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  32 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  37.01 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  33.12 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  32 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  32 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  33.77 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  33.77 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  32 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  32 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  32 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  32 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  32.24 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  31.58 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.33 
 
 
286 aa  74.7  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.77 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  38.31 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35.33 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  38.31 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  32.05 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  33.77 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.33 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.17 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  31.85 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  33.75 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  33.11 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.79 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.42 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.62 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  33.56 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  36.67 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  32.92 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  32.92 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.46 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  36.84 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  34.01 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  34.16 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  32.91 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.26 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.51 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.14 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  32.68 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.19 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.09 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33.33 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  34 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  32 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.24 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  34 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.68 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.76 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  36.18 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  37.01 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  35.29 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  36.18 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  32.26 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  31.65 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>