More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1409 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  66.43 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  60.71 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  43.17 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  41.43 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  40.43 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  37.86 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  37.32 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  33.57 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.86 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.23 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  37.67 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  36.36 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  35.66 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.72 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.36 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.43 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  31.51 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  37.76 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30.99 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30.99 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.5 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  33.81 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.99 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30.99 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.69 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.28 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.81 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  36.3 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  34.48 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  33.56 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.04 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.85 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  32.28 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  30.07 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.5 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  32.86 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  35 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.64 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  32.86 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  35.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.07 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  32.14 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  32.65 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  32.43 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  36 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  31.43 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.34 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.08 
 
 		 150 aa  66.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.85 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  31.03 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  34.64 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.03 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.62 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  34.64 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>