More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1173 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  292  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  81.63 
 
 
147 aa  244  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  81.63 
 
 
147 aa  244  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  75.34 
 
 
148 aa  226  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  66.67 
 
 
147 aa  199  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  64.63 
 
 
147 aa  196  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  62.59 
 
 
147 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  67.35 
 
 
147 aa  192  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  63.95 
 
 
147 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  53.38 
 
 
148 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  42.18 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  40.82 
 
 
147 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  43.33 
 
 
144 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  42 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  42.67 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  42 
 
 
144 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  44.59 
 
 
144 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  43.92 
 
 
144 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  42.57 
 
 
168 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  42.18 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 
144 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  41.89 
 
 
144 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  41.89 
 
 
144 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  43.33 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 
171 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  39.13 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  39.13 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  39.73 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  39.46 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  40.14 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  39.46 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  40.27 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  39.46 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  43.79 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  41.06 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  35.14 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.14 
 
 
157 aa  90.5  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  33.78 
 
 
146 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  34.93 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  33.78 
 
 
146 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.56 
 
 
187 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  38.26 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  35.19 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  34.97 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  35.19 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  43.05 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  40.14 
 
 
141 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.76 
 
 
145 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.91 
 
 
150 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  40.4 
 
 
149 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  38.26 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.81 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.91 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.91 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  36.05 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.77 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  38.93 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.25 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  41.45 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  41.45 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.19 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.57 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.18 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.58 
 
 
180 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.11 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.67 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.39 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.72 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.27 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  34.38 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  41.5 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>