More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3028 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  86.09 
 
 
151 aa  268  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  88.08 
 
 
151 aa  257  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  80.13 
 
 
151 aa  256  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  80.13 
 
 
151 aa  256  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  68.21 
 
 
151 aa  224  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  35.37 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  39.49 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.51 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  34.19 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.25 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  38.41 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  36.3 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30.67 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  30.67 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  30.67 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.26 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  30.67 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  30.67 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.64 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  30.67 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.67 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.33 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.41 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.78 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.67 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  35.48 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.34 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  28.57 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.77 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  32.45 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.24 
 
 
180 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.08 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  34 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.58 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.54 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.78 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.1 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.54 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  33.55 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  29.23 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.86 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  31.03 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  36.29 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.67 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  32.43 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  32.43 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.79 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.07 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  32.41 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  33.33 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.77 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.89 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.93 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.95 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  27.95 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.93 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.56 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  31.79 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.76 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  28.95 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  39.76 
 
 
217 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  31.76 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.14 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>