More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0954 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 
141 aa  286  8e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  44.52 
 
 
155 aa  134  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  43.26 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  44.59 
 
 
143 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  37.14 
 
 
142 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.14 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.27 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  36 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  36.23 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.36 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.06 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  36 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  32.67 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  34.25 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.14 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.94 
 
 
158 aa  77  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.46 
 
 
164 aa  77  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.29 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.23 
 
 
162 aa  76.6  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.97 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  31.29 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.62 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  35.42 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.69 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.16 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.79 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  37.41 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.88 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  36 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.58 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  29.38 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  34.93 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  34.93 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.57 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  33.33 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  31.01 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.91 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.33 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.94 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  31.01 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.72 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.65 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  31.87 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.76 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  32.28 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  34.48 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  32.28 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  31.76 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  31.87 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.94 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.86 
 
 
300 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.71 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  30.99 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.51 
 
 
166 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.5 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.63 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.5 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.46 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>