More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0309 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  49.3 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  46.1 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  46.81 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  46.1 
 
 
142 aa  133  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.75 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.01 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  44.06 
 
 
147 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.97 
 
 
157 aa  90.5  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  33.58 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.27 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.14 
 
 
141 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
148 aa  87  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.57 
 
 
151 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.92 
 
 
149 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  38.1 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.86 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  34.56 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.16 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  84.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  84  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.14 
 
 
280 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.91 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.21 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  33.1 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  35.03 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.69 
 
 
300 aa  78.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.99 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  38.51 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.97 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  32.3 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.08 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  31.68 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.03 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.57 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.44 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  30.94 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.21 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.99 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.26 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.39 
 
 
297 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  33.11 
 
 
297 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.14 
 
 
296 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.25 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.14 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.43 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  34.51 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  31.54 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.68 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  31.58 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.64 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  30.14 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  31.29 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.65 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.43 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  29.17 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.56 
 
 
309 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  29.45 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  30.72 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.52 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  30.87 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  29.93 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.78 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  30.56 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>