More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3063 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  567  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  48.99 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  44.67 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  46.94 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  40.85 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  44.67 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  37.83 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  47.14 
 
 		 151 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  48.65 
 
 		 152 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.42 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.63 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  46.48 
 
 		 149 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  32.13 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  31.95 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  37.66 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  37.66 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  37.66 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  37.66 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.66 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  37.66 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.66 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.11 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  43.14 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.6 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  29.24 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  33.1 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  33.67 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.87 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.57 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.67 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.28 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.04 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.48 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.48 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  31.49 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  36.88 
 
 		 140 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.63 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  36.88 
 
 		 140 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 152 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.55 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.26 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  37.67 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.27 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  33.56 
 
 		 152 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.35 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  36.24 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.51 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.82 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.99 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.67 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.25 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.99 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.99 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  34.33 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.8 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.34 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  36.88 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  38.57 
 
 		 142 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.13 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  38.13 
 
 		 140 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  34.97 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.59 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.97 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.72 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.63 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.32 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  39.16 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.21 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  20.89 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.13 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  31.29 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>