More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6200 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  95.71 
 
 		 163 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  89.82 
 
 		 167 aa  280  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  82.63 
 
 		 167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  68.55 
 
 		 164 aa  203  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  60.61 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  68.55 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  68.55 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  68.55 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  68.55 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  68.55 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  68.55 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  58.67 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  54.76 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  57.05 
 
 		 168 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  53.42 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  52.38 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  53.42 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  53.42 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  46.88 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  48.05 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  49.66 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  48.63 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  47.59 
 
 		 200 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  46.67 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  47.26 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  46.21 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  47.59 
 
 		 200 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  47.59 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  47.59 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  47.59 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  47.59 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  47.59 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  45.52 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  47.65 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  47.65 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  44.14 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  44.3 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  40.69 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  43.75 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  42.18 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  40 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  40.69 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  44.3 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  40.4 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  42 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  42 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  43.05 
 
 		 184 aa  94  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  42.28 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  38.78 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  37.93 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  42.86 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  42.86 
 
 		 201 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  39.6 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  37.93 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  42.86 
 
 		 201 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  40.27 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  42.86 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.82 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  36.09 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 318 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  37.65 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  40.67 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.46 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  36 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  43.26 
 
 		 317 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  36.91 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  35.86 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.27 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  42.77 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>