More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1769 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  98.05 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  93.79 
 
 		 154 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  87.01 
 
 		 163 aa  276  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  85.71 
 
 		 163 aa  273  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  85.71 
 
 		 163 aa  273  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  86.67 
 
 		 165 aa  273  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  86 
 
 		 165 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  86 
 
 		 165 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  85.06 
 
 		 163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  85.06 
 
 		 163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  85.06 
 
 		 163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  85.06 
 
 		 163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  85.06 
 
 		 163 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  86 
 
 		 165 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  85.33 
 
 		 165 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  85.33 
 
 		 165 aa  269  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  85.33 
 
 		 165 aa  269  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  46.81 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  40.65 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  37.76 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  32.87 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.14 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.14 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  35.46 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  35.46 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.69 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.79 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  24.64 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.5 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.05 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.73 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.37 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.45 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.08 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.28 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.34 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.17 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  27.86 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.66 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.05 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  28.12 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.52 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  34.15 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.08 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  25 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  31.58 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  27.46 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.1 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.08 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.25 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.22 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.95 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  29.19 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.17 
 
 		 280 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.56 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.1 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.84 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.52 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.08 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.07 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.03 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  24.68 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  26.28 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.87 
 
 		 281 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.4 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.89 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.29 
 
 		 303 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  28.47 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>