More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3527 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  100 
 
 		 151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  61.84 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  60 
 
 		 149 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  57.72 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  55.03 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  51.77 
 
 		 164 aa  146  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  50 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  50 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  51.45 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  44.97 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  47.1 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  41.72 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  43.24 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.28 
 
 		 180 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.56 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  44.54 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.16 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.84 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.96 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  42.97 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.16 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.41 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.9 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 143 aa  97.1  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.89 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.46 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.97 
 
 		 208 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  39.16 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.55 
 
 		 290 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.72 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.51 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.46 
 
 		 307 aa  90.9  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  35.1 
 
 		 200 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  40.56 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.01 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35.21 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.93 
 
 		 288 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  34.97 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  32.2 
 
 		 176 aa  87.8  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.86 
 
 		 207 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.57 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.76 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  37.5 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  34.97 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.66 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.27 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.19 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.19 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  36.84 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.51 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.16 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.17 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  39.31 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.93 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.69 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.33 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.57 
 
 		 286 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  38.67 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  34.23 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  36 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  33.11 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  33.77 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  33.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  33.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  33.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  36 
 
 		 187 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  33.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>