More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1171 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  82 
 
 		 150 aa  252  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  70.86 
 
 		 153 aa  222  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  69.8 
 
 		 152 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  67.32 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  68.21 
 
 		 152 aa  205  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  60.93 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  40 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  39.33 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  37.16 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  41.1 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.67 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  37.01 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  34.46 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  40.27 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  37.58 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.9 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.9 
 
 		 170 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  38.26 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  36 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.84 
 
 		 320 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  37.06 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  37.59 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 162 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.53 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  36.88 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  36.36 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.71 
 
 		 287 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  37.66 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  34.42 
 
 		 276 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.84 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  34.72 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  37.84 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 172 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.21 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  90.5  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.72 
 
 		 304 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  38.96 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  39.29 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  38.96 
 
 		 164 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.56 
 
 		 290 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.28 
 
 		 314 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  35.81 
 
 		 291 aa  87.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  34.9 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  35.17 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  38.31 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  39.13 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  35.62 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.03 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.03 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  34.23 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.42 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.87 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  41.78 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.6 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.87 
 
 		 208 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  32.24 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  36.81 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  33.79 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.1 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.67 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  36.81 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  33.79 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.27 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  36.81 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  37.5 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>