More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1570 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  64.43 
 
 		 212 aa  198  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  62.09 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  55.19 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  53.9 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  41.1 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40.28 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  39.58 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  38.62 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.5 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  36.55 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  35.86 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  38.3 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.06 
 
 		 304 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.11 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.9 
 
 		 169 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  34.42 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  36.67 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.67 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  33.99 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36.49 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  34.72 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.57 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  33.55 
 
 		 276 aa  80.9  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  34.27 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.56 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.67 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.99 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  33.11 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  33.8 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.14 
 
 		 320 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.25 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.1 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  31.94 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  33.56 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  33.79 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.64 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  33.1 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.51 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.58 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  36.43 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  32.65 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.16 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  32.17 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  36.49 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  36.49 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  31.21 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.13 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.42 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  31.25 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  37.5 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  30.77 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.53 
 
 		 187 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.77 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>