More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0228 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  292  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  67.36 
 
 
144 aa  220  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  54.23 
 
 
148 aa  150  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  44.37 
 
 
145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  44.67 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 
145 aa  110  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  43.71 
 
 
145 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  43.62 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
142 aa  104  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 
147 aa  100  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  37.25 
 
 
157 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  43.54 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  41.89 
 
 
155 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.89 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.03 
 
 
300 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  37.5 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.78 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  38.82 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  40.85 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.67 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.62 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.1 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  39.16 
 
 
294 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  40.69 
 
 
150 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 
149 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  42.18 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.07 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.38 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.07 
 
 
180 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.73 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  41.06 
 
 
148 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  37.67 
 
 
150 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  38.89 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  38.41 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.28 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.81 
 
 
208 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.18 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  38.31 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  37.24 
 
 
142 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  42.25 
 
 
301 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  37.33 
 
 
158 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  39.58 
 
 
148 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 
153 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  33.8 
 
 
154 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.89 
 
 
297 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.81 
 
 
290 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.67 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.16 
 
 
287 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  39.19 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.86 
 
 
207 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.01 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.56 
 
 
159 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.89 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.33 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.99 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.24 
 
 
149 aa  87  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.66 
 
 
150 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 
149 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.53 
 
 
151 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.53 
 
 
151 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.91 
 
 
305 aa  86.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  35.81 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.33 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  42.38 
 
 
155 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  37.93 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.49 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
156 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  35.71 
 
 
158 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.81 
 
 
286 aa  84  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.07 
 
 
155 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.46 
 
 
153 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  32.9 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 
142 aa  84  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.24 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  39.6 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  39.04 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.1 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.93 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  36.62 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  39.6 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  39.6 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  37.93 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.21 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>