More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0118 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  67.36 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  52.82 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  41.61 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  38.36 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  39.46 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.19 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.66 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.1 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.72 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.84 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  38.78 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.06 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  40.14 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36.99 
 
 		 207 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  39.72 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  37.33 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.73 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.73 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  39.46 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.17 
 
 		 286 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  34.87 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  34.87 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.73 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.08 
 
 		 305 aa  87  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  38.56 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  38.56 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.19 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.93 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.91 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  34.87 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  33.57 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  38.56 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.48 
 
 		 290 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34.03 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.8 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.72 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.54 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  37.93 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36.81 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  39.19 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.11 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  35.95 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.93 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  36.73 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.99 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  36.18 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.36 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  36.77 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.89 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  37.58 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  37.24 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  35.17 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.29 
 
 		 300 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.1 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.62 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  36.73 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  35.33 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.86 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.76 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  36.73 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  34.9 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.41 
 
 		 301 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.19 
 
 		 288 aa  80.1  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>