More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2886 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  52.82 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  54.23 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  42.18 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  39.19 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  39.44 
 
 		 320 aa  92  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  42.21 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40 
 
 		 180 aa  91.3  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  36.91 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  41.29 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  37.32 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.14 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.05 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  43.05 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.41 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  38.62 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  39.31 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36.05 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  36.6 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.46 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.42 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  39.31 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.32 
 
 		 301 aa  84  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  38.36 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  38.51 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.42 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.41 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  39.75 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.73 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  40.69 
 
 		 288 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  39.49 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  38.89 
 
 		 294 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  40.54 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.19 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  39.16 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40.91 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  40.13 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 		 325 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.5 
 
 		 208 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  37.84 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.65 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  37.82 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  37.5 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  37.16 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.72 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  35.86 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  41.1 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.19 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.5 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  38.46 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  37.84 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.66 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  37.33 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  37.84 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  39.58 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  39.74 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  36.42 
 
 		 297 aa  78.2  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.93 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  38.46 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.23 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.16 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.24 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.33 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.03 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  37.84 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.33 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.41 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  33.79 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.36 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.99 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>