More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2014 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  100 
 
 
307 aa  605  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.69 
 
 
290 aa  192  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  41.98 
 
 
287 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  41.3 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  41.3 
 
 
297 aa  175  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.72 
 
 
286 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.45 
 
 
300 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  38.36 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40.59 
 
 
305 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.07 
 
 
301 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.86 
 
 
415 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  39.25 
 
 
283 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  35.35 
 
 
281 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  37.54 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  35.91 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.67 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.33 
 
 
304 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.56 
 
 
320 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 
297 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.44 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  46.26 
 
 
155 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  47.55 
 
 
144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
145 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  27.02 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  44.06 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  34.11 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  41.43 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  33.87 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.59 
 
 
150 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.57 
 
 
276 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  38.79 
 
 
169 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  46.26 
 
 
152 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  47.22 
 
 
158 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  41.89 
 
 
156 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  44.44 
 
 
180 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.62 
 
 
150 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  45.1 
 
 
159 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.25 
 
 
449 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  40 
 
 
153 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.26 
 
 
152 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.17 
 
 
150 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  46.81 
 
 
156 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  42.57 
 
 
156 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  31.96 
 
 
281 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  41.38 
 
 
147 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.75 
 
 
164 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 
325 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  31.89 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.3 
 
 
149 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 
317 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36 
 
 
148 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  45.39 
 
 
153 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  34.8 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.46 
 
 
151 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  41.26 
 
 
149 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.47 
 
 
147 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.92 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  46.85 
 
 
141 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  37.59 
 
 
144 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  37.24 
 
 
148 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  41.18 
 
 
136 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  32 
 
 
325 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  45.07 
 
 
154 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.19 
 
 
148 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  39.83 
 
 
120 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  30.51 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.56 
 
 
157 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.83 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.88 
 
 
145 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  41.38 
 
 
152 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  29.57 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.24 
 
 
159 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 
147 aa  90.9  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  39.16 
 
 
151 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  34.72 
 
 
305 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.19 
 
 
156 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  42.36 
 
 
144 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  44.67 
 
 
151 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  42.55 
 
 
138 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.33 
 
 
150 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  40 
 
 
152 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  39.46 
 
 
150 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  37.84 
 
 
153 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
144 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
314 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.5 
 
 
148 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
143 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  27.92 
 
 
303 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  33.33 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  29.47 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.09 
 
 
165 aa  85.9  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  38.19 
 
 
145 aa  85.9  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
128 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  40 
 
 
147 aa  85.9  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  28.93 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>