More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1603 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  100 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  62.68 
 
 
207 aa  226  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  52.41 
 
 
152 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  51.09 
 
 
138 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  43.9 
 
 
169 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  47.22 
 
 
144 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.68 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  43.84 
 
 
149 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  45.77 
 
 
290 aa  109  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  40.43 
 
 
150 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.72 
 
 
150 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  44.52 
 
 
307 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  46.56 
 
 
281 aa  108  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  42.07 
 
 
144 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  45.99 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.96 
 
 
180 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  46.43 
 
 
142 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  44.7 
 
 
136 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  41.21 
 
 
297 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  42.18 
 
 
153 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  45.52 
 
 
286 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  42.55 
 
 
145 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  41.45 
 
 
152 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  40.28 
 
 
150 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.97 
 
 
149 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.71 
 
 
159 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  42.04 
 
 
280 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.66 
 
 
141 aa  99.8  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  39.6 
 
 
155 aa  99  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.79 
 
 
150 aa  98.6  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  45.77 
 
 
158 aa  99  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  42.86 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  41.26 
 
 
301 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  40.85 
 
 
147 aa  98.6  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  39.16 
 
 
148 aa  98.2  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  38.93 
 
 
301 aa  98.2  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  42.28 
 
 
153 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  43.75 
 
 
305 aa  95.9  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.97 
 
 
151 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  41.78 
 
 
283 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 
159 aa  95.9  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
147 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  95.1  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.87 
 
 
149 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  41.96 
 
 
156 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.3 
 
 
415 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.28 
 
 
300 aa  92  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
145 aa  92  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.19 
 
 
151 aa  91.7  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.03 
 
 
151 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.62 
 
 
152 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.73 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  41.3 
 
 
283 aa  89.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
153 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.58 
 
 
148 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
143 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.16 
 
 
150 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.97 
 
 
152 aa  89.4  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 
128 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.69 
 
 
147 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.41 
 
 
149 aa  89  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.1 
 
 
164 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  43.88 
 
 
144 aa  88.6  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.65 
 
 
157 aa  88.6  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.33 
 
 
156 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  47.06 
 
 
118 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
147 aa  86.3  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  36.17 
 
 
149 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  40.43 
 
 
141 aa  85.5  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.56 
 
 
153 aa  85.1  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.3 
 
 
133 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.62 
 
 
148 aa  85.1  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
145 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.81 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.17 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  38.4 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.89 
 
 
147 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
147 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  35.66 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  39.61 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  31.54 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  38.89 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.82 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.21 
 
 
142 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  35.17 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.25 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  34.25 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>