More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1573 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  100 
 
 
149 aa  295  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  63.95 
 
 
150 aa  190  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  62.59 
 
 
151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  51.02 
 
 
156 aa  130  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  45.58 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  43.84 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  46.94 
 
 
153 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  49.66 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  42.47 
 
 
152 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  42.86 
 
 
156 aa  103  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  43.15 
 
 
297 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  43.06 
 
 
145 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  45.52 
 
 
133 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.14 
 
 
152 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.04 
 
 
207 aa  98.6  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  41.67 
 
 
180 aa  97.4  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  48.94 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  44.59 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  42.36 
 
 
290 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  42.07 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.19 
 
 
288 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  40.27 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.17 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  40.97 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.46 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.43 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.86 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  37.84 
 
 
301 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.71 
 
 
159 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  37.67 
 
 
300 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  38.89 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.69 
 
 
415 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.06 
 
 
159 aa  87  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.73 
 
 
286 aa  87  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  34.03 
 
 
150 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  41.89 
 
 
301 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.26 
 
 
307 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  34.75 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.33 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.42 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.69 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.24 
 
 
294 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  34.78 
 
 
165 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.79 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  40.56 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.41 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  36.43 
 
 
281 aa  82  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.5 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  36.99 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.41 
 
 
287 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40.85 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.1 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  36.11 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  39.58 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.93 
 
 
280 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  38.89 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.24 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1666  UspA domain protein  42.11 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.189674  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  34.23 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.56 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  32.79 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  39.22 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.39 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.25 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.8 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.72 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  38.78 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  32.47 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  35.9 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  35.66 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  32.88 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.17 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  37.09 
 
 
295 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  39.74 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>