More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0914 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  100 
 
 		 154 aa  318  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  74.51 
 
 		 155 aa  245  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  64.24 
 
 		 212 aa  199  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  61.22 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  55.19 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  40.54 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  37.76 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  40.27 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  37.06 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  39.19 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.14 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.78 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.46 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  36.62 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.67 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.67 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  33.57 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  34.67 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.76 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.23 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.96 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.89 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  30.86 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  34.48 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  34.97 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.2 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.92 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.94 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  30.52 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  34.75 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  32.86 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  31.61 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  33.1 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.69 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.17 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  33.11 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.87 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  29.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.97 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.56 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.87 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.78 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.1 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.52 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.52 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.05 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.86 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.55 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  31.03 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.61 
 
 		 290 aa  70.5  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.93 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  30.5 
 
 		 390 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.82 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.77 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.86 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.52 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  32.43 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.63 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  27.61 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  27.66 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>