More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1966 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1966  universal stress protein  100 
 
 
149 aa  294  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  100 
 
 
149 aa  294  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  85.91 
 
 
149 aa  251  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  51.01 
 
 
148 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  45.33 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  47.65 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  44.97 
 
 
171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  48.67 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  40.94 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  46 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  42.48 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  40 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 
147 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  40.94 
 
 
147 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  42 
 
 
147 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
149 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  40.27 
 
 
144 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  40.67 
 
 
148 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  40.67 
 
 
148 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  40.94 
 
 
144 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  44.9 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  40.37 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  36.24 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  37.58 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  37.09 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  36.91 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  36 
 
 
148 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.6 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  37.27 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.76 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  38.16 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  40.13 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  39.61 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  38.16 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.11 
 
 
173 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  32.91 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  32.91 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  37.5 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  38.82 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  37.5 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.87 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
144 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.09 
 
 
151 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  36.67 
 
 
144 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
144 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
145 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.13 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  33.11 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.79 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.81 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  39.6 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  30.87 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  35.14 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  38.26 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.57 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  30.87 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.06 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.99 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  32.47 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  35.53 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  37.16 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  30.87 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  40 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  30 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.61 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  35.95 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  30 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.26 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34.69 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>