More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4059 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  299  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  72.79 
 
 		 147 aa  230  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  70.75 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  59.18 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  57.82 
 
 		 147 aa  176  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  56.46 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  58.5 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  57.82 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  55.78 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  57.14 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  54.42 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  53.74 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  55.1 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  54.42 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  54.42 
 
 		 143 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  54.42 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3680  universal stress protein  53.06 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  53.06 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  53.74 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  51.33 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  51.02 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  37.18 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.11 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.37 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.65 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  32.65 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.99 
 
 		 304 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.77 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  32.65 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.4 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.33 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.77 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  33.55 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.03 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.67 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.08 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.17 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  31.72 
 
 		 212 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.37 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  34.62 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  26.57 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  30.26 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.41 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.33 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30.26 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 274 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  31.08 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.41 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  32.68 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  32.68 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  27.7 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.93 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.93 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.08 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.17 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  28.28 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.45 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.45 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.67 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.17 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  30.56 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 144 aa  57  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  27.81 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  28.17 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.03 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  22.38 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.17 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.77 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  26.49 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  26.32 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.41 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  27.15 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>